35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2923 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2923  periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161015  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2769  hypothetical protein  90.61 
 
 		 245 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1107  hypothetical protein  89.8 
 
 		 245 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0085  hypothetical protein  56.78 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2800  hypothetical protein  60.36 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.462048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4035  hypothetical protein  54.2 
 
 		 255 aa  244  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5194  hypothetical protein  49.36 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4078  periplasmic protein-like protein  50.47 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4458  hypothetical protein  48.51 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1773  lipoprotein signal peptide  49.55 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2204  hypothetical protein  48.29 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158703  normal  0.503307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2522  hypothetical protein  48.21 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2247  hypothetical protein  48.21 
 
 		 258 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1070  hypothetical protein  47.25 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0943  hypothetical protein  46.72 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2581  hypothetical protein  44.12 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2542  hypothetical protein  45.11 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2236  hypothetical protein  44.53 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1615  hypothetical protein  40.94 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1669  hypothetical protein  40.94 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1257  hypothetical protein  40.43 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1911  periplasmic protein-like protein  43.84 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00932683  normal  0.0114892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0812  periplasmic protein-like  37.95 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1908  periplasmic protein-like protein  39 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0729  hypothetical protein  34.44 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.870301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  31.42 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4181  hypothetical protein  30.21 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0140439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4040  hypothetical protein  30.97 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4193  periplasmic protein  30.97 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5254  hypothetical protein  30.97 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4165  periplasmic protein  30.97 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03691  hypothetical protein  30.95 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03640  hypothetical protein  30.95 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4124  hypothetical protein  31.98 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2357  periplasmic protein-like protein  29.78 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>