17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1102 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  0.0200778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  77.83 
 
 		 223 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  77.07 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  48.91 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  41.86 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  33.51 
 
 		 315 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  29.47 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  33.9 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  33.06 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  29.75 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  30.77 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  28.14 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  27.41 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  29.6 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  29.79 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  32.14 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  28.68 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>