26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3195 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  100 
 
 		 74 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  64.38 
 
 		 74 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  67.57 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  68.18 
 
 		 74 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  60.61 
 
 		 73 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  50 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  55.41 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  51.35 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  52.94 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  45.83 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  41.67 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0194  toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  38.67 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  42.19 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1965  CopG-like DNA-binding  44.9 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0374946  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2403  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.83 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1337  CopG-like DNA-binding protein  46.43 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000429607 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10640  hypothetical protein  31.08 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1360  hypothetical protein  36.67 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.937532  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1238  hypothetical protein  36.67 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1271  CopG domain protein DNA-binding domain protein  35.29 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  41.79 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0325  helix-turn-helix protein, CopG  30.14 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>