More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3063 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  78.35 
 
 		 432 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  78.64 
 
 		 430 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  79.13 
 
 		 430 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  75.06 
 
 		 430 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  76.94 
 
 		 429 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  77.62 
 
 		 427 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  78.88 
 
 		 430 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  78.35 
 
 		 432 aa  688    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  100 
 
 		 427 aa  892    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  75.35 
 
 		 431 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  76.4 
 
 		 435 aa  681    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  81.64 
 
 		 421 aa  719    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  77.53 
 
 		 426 aa  681    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  74.76 
 
 		 424 aa  665    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  78.1 
 
 		 432 aa  688    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  76.53 
 
 		 431 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  75.66 
 
 		 428 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  65.44 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  48.11 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  70.56 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  44.17 
 
 		 414 aa  358  8e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  42.46 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  40.14 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  40.3 
 
 		 468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  39.56 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  40.05 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  39.55 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  40.3 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  38.2 
 
 		 450 aa  280  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  39.12 
 
 		 464 aa  279  8e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  38.2 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  39.42 
 
 		 451 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  38.44 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  38.69 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  39.22 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  36.49 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  35.66 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  37.57 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  36.34 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  37.11 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3394  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 1823 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 1912 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213364 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.95 
 
 		 341 aa  136  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.37 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2930  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 1912 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0842557 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.64 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 		 337 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 		 339 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.37 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.05 
 
 		 342 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.33 
 
 		 342 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  25.98 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.34 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.74 
 
 		 342 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.68 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.19 
 
 		 332 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.77 
 
 		 331 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.19 
 
 		 332 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.77 
 
 		 331 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.77 
 
 		 331 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.9 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.49 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.19 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.19 
 
 		 332 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  26.19 
 
 		 332 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 		 340 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.35 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.99 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.19 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 		 340 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.17 
 
 		 335 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 		 335 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.3 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.99 
 
 		 332 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 		 331 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 		 347 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.5 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.09 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.93 
 
 		 329 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 		 339 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.99 
 
 		 332 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.57 
 
 		 330 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  25.57 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.91 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.37 
 
 		 639 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2855  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.07 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>