177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2916 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
241 aa  473  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.74 
 
 
271 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.09 
 
 
275 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.09 
 
 
271 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.09 
 
 
271 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.09 
 
 
271 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.09 
 
 
271 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.09 
 
 
271 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  36.53 
 
 
256 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  26.79 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4371  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.29 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  32 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  39 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.12 
 
 
266 aa  95.5  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.56 
 
 
314 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.36 
 
 
270 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  32.37 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.67 
 
 
242 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.92 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.92 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.79 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.84 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.68 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  26.06 
 
 
208 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.12 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.12 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.12 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1036  HetI protein  33.89 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.52 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  24.47 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  25.74 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  30.41 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.41 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  30.86 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.27 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.88 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  30.86 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.63 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.28 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.12 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.95 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.26 
 
 
198 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.55 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.65 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.49 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.37 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.12 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.39 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.81 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4807  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.42 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  hitchhiker  0.000293252 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.63 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.37 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.89 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.4 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.5 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  40.18 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  31.91 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.31 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0099  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.81 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.5 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.5 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.74 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  33.77 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1245  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.95 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  29.38 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.71 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.78 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.62 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.53 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  20.95 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.24 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.84 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.14 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.63 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2496  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.94 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.580668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.46 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.72 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1676  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.44 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 
219 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.05 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.01 
 
 
329 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2731  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.8 
 
 
332 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.03 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4498  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.28 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2680  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.17 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172799  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  33.14 
 
 
832 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.71 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.57 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.5 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.66 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0154  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.03 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.749377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1604  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.47 
 
 
318 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
328 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.57 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  26.49 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.11 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>