More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1603 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1603  PhoH-like protein  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3741  PhoH family protein  61.11 
 
 
257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1072  PhoH family protein  60.27 
 
 
253 aa  293  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203632  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0596  phosphate starvation-inducible protein  56.78 
 
 
391 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.427062  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0864  PhoH family protein  56.41 
 
 
397 aa  232  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0064  PhoH family protein  48.92 
 
 
309 aa  230  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178859 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  51.71 
 
 
345 aa  229  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  54.95 
 
 
360 aa  229  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  55.45 
 
 
320 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  50 
 
 
315 aa  229  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  56.44 
 
 
327 aa  228  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  55.17 
 
 
361 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  55 
 
 
348 aa  228  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  54.77 
 
 
335 aa  228  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  50.46 
 
 
315 aa  228  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  50.46 
 
 
315 aa  228  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  53.37 
 
 
370 aa  227  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  55.56 
 
 
319 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  54.95 
 
 
320 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  55.94 
 
 
327 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  55.94 
 
 
353 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0022  PhoH family protein  55.84 
 
 
314 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.123804  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3456  PhoH-like protein  53.96 
 
 
319 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  53.96 
 
 
357 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  53.96 
 
 
357 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19541  PhoH-like phosphate starvation-inducible protein  51.54 
 
 
323 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17250  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  55.5 
 
 
350 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.465991  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  50.75 
 
 
327 aa  222  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  50.75 
 
 
327 aa  222  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  53.54 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  51.49 
 
 
335 aa  221  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  52.48 
 
 
353 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  47.14 
 
 
365 aa  221  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1156  PhoH family protein  54.04 
 
 
340 aa  221  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2706  PhoH family protein  52.97 
 
 
353 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  56.35 
 
 
338 aa  221  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  53.47 
 
 
338 aa  221  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  53.54 
 
 
319 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  53.54 
 
 
319 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  53.27 
 
 
345 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  53.54 
 
 
319 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  53.54 
 
 
319 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  53.54 
 
 
319 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  53.47 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  53.03 
 
 
319 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  53.54 
 
 
319 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  52.97 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  53.03 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1546  PhoH family protein  53.96 
 
 
350 aa  220  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  53.54 
 
 
319 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  51.74 
 
 
328 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12394  phoH-like protein phoH1 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  53.96 
 
 
352 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  52.79 
 
 
364 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  54.95 
 
 
375 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1600  hypothetical protein  47.52 
 
 
316 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  52.97 
 
 
381 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  53.27 
 
 
349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  53.54 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3159  PhoH family protein  53.77 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00307849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  51.98 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  52.97 
 
 
333 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1912  PhoH family protein  51.72 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11730  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  54.77 
 
 
346 aa  218  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  52.97 
 
 
373 aa  218  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  51.98 
 
 
351 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  52.97 
 
 
337 aa  218  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  52.76 
 
 
351 aa  218  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  50.5 
 
 
347 aa  218  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3832  PhoH family protein  52.66 
 
 
329 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  54.46 
 
 
339 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1396  hypothetical protein  47.52 
 
 
316 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  53.54 
 
 
357 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1511  PhoH-like protein  56.06 
 
 
303 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  47.32 
 
 
348 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  53.3 
 
 
338 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  55.33 
 
 
363 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  52.26 
 
 
344 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1658  PhoH family protein  53.27 
 
 
376 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  52.48 
 
 
348 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0884  PhoH-like phosphate starvation-inducible protein  55.61 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.39441  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1775  phosphate starvation-induced protein  51.52 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.901151  normal  0.888471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13470  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  51.49 
 
 
353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  52.48 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2232  PhoH family protein  53.77 
 
 
362 aa  215  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00260346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  52.22 
 
 
351 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  54.46 
 
 
346 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  54.46 
 
 
346 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1750  PhoH family protein  52.97 
 
 
376 aa  215  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224703  normal  0.417547 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13311  PhoH-like phosphate starvation-inducible protein  50.44 
 
 
322 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.631543  normal  0.530909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  50.5 
 
 
342 aa  215  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12340  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  51.98 
 
 
357 aa  215  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  52.28 
 
 
328 aa  214  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  51.49 
 
 
316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  53.3 
 
 
337 aa  214  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1184  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  50.99 
 
 
319 aa  214  7e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4627  PhoH family protein  53.27 
 
 
344 aa  214  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  52.71 
 
 
369 aa  214  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  52.79 
 
 
345 aa  214  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  48.4 
 
 
352 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17041  PhoH-like phosphate starvation-inducible protein  47.39 
 
 
325 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>