187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0892 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  100 
 
 
418 aa  850    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  45.37 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  45.91 
 
 
389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  44.55 
 
 
401 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  41.44 
 
 
432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  38.94 
 
 
394 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  38.94 
 
 
394 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  38.94 
 
 
394 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  40.48 
 
 
385 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  40.87 
 
 
384 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  37.65 
 
 
419 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  38.44 
 
 
404 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  37.53 
 
 
412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  36.21 
 
 
427 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  36.2 
 
 
370 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  36.75 
 
 
401 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  46.82 
 
 
225 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  46.89 
 
 
244 aa  179  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  46.23 
 
 
226 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  45.28 
 
 
233 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  43.78 
 
 
245 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  41.58 
 
 
192 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  39.68 
 
 
192 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  41.8 
 
 
191 aa  153  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  40.53 
 
 
192 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  38.62 
 
 
192 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  40.53 
 
 
192 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  40.53 
 
 
192 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  40.53 
 
 
192 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  40.53 
 
 
192 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  41.27 
 
 
191 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  41.27 
 
 
191 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  41.27 
 
 
191 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  39.15 
 
 
192 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  41.27 
 
 
191 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  38.62 
 
 
192 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  41.8 
 
 
191 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  40.11 
 
 
191 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  38.62 
 
 
248 aa  146  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  37.57 
 
 
191 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  39.68 
 
 
191 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  39.68 
 
 
191 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  40.21 
 
 
191 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  37.37 
 
 
192 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  38.3 
 
 
191 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  38.62 
 
 
192 aa  143  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  38.62 
 
 
192 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  37.04 
 
 
191 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  36.51 
 
 
191 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  33.68 
 
 
192 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  38.1 
 
 
192 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  38.62 
 
 
192 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  35.64 
 
 
191 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  36.36 
 
 
191 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  38.62 
 
 
191 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  38.1 
 
 
222 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  38.62 
 
 
191 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  39.15 
 
 
191 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  35.11 
 
 
191 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  39.15 
 
 
191 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1939  stress protein  34.62 
 
 
184 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  35.98 
 
 
191 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  35.83 
 
 
191 aa  130  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  39.88 
 
 
192 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  39.88 
 
 
192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  39.88 
 
 
192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  39.88 
 
 
192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  39.88 
 
 
192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  37.37 
 
 
192 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  38.78 
 
 
232 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  39.29 
 
 
192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  38.82 
 
 
191 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  39.29 
 
 
192 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  38.38 
 
 
191 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  39.29 
 
 
192 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  36.09 
 
 
191 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  33.68 
 
 
194 aa  126  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  32.26 
 
 
189 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  31.75 
 
 
191 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  35.23 
 
 
205 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  33.68 
 
 
196 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  28.62 
 
 
402 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  33.68 
 
 
196 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  33.68 
 
 
194 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  33.68 
 
 
196 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  33.68 
 
 
194 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  29.49 
 
 
401 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  34.2 
 
 
194 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  33.33 
 
 
190 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  35.98 
 
 
191 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  36.63 
 
 
218 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  33.68 
 
 
194 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  33.68 
 
 
194 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  34.72 
 
 
193 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  33.92 
 
 
192 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  33.68 
 
 
194 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  35.48 
 
 
186 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  34.5 
 
 
192 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  36.28 
 
 
233 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  38.82 
 
 
194 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>