More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2795 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  100 
 
 
315 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  94.59 
 
 
315 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  60.32 
 
 
316 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  61.49 
 
 
329 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  56.4 
 
 
322 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  52.13 
 
 
320 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  53.27 
 
 
311 aa  291  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  52.1 
 
 
325 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  49.51 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  49.67 
 
 
311 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  49.84 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  49.51 
 
 
325 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  43.38 
 
 
348 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  42.09 
 
 
344 aa  248  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  45.71 
 
 
336 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  40.9 
 
 
358 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  39.81 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  39.81 
 
 
319 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  43.51 
 
 
312 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  42.86 
 
 
336 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  46.54 
 
 
325 aa  222  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  40.53 
 
 
363 aa  222  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  42.9 
 
 
313 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  42.58 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  42.58 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  42.26 
 
 
313 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  42.58 
 
 
313 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  42.14 
 
 
345 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  44.57 
 
 
333 aa  208  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  38.46 
 
 
325 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  37.38 
 
 
326 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  44.09 
 
 
323 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  44.63 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  39.1 
 
 
334 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  40.85 
 
 
348 aa  195  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  38.85 
 
 
322 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  44.01 
 
 
329 aa  182  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  33.64 
 
 
311 aa  165  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  33.64 
 
 
311 aa  165  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  34.05 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.33 
 
 
316 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.41 
 
 
316 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  30.03 
 
 
328 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.97 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  27.64 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  27.64 
 
 
323 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  31.23 
 
 
340 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  27.64 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  27.64 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  27.64 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  27.64 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  27.64 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  27.64 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  30.18 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  27.64 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  29.37 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  30.39 
 
 
304 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  27.27 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  30.18 
 
 
345 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  30.18 
 
 
345 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.57 
 
 
305 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  27.78 
 
 
378 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  29.59 
 
 
478 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  28.67 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  30.18 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  26.81 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  33 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  33 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  33 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  31.83 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  30.43 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  26.95 
 
 
354 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  26.95 
 
 
354 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  26.95 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  28.31 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  27.37 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  27.41 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  28.83 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  28.72 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  26.6 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  31.71 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  27.87 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  26.6 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  30.88 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  27.87 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  26.6 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  30.33 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  27.53 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  28.3 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.6 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  26.6 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.63 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  26.57 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  31.23 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  25.59 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  29.82 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  29.82 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  29.82 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  30.66 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  30.21 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>