30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5161 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  100 
 
 		 297 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1497  mucin-associated surface protein  96.07 
 
 		 281 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000680781 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  79.39 
 
 		 296 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  33.85 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  33.77 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  33.46 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  35.58 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  36.46 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  29.27 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  31.43 
 
 		 365 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  36.46 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  36.46 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  38.46 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  35.45 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  46.67 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  40 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  28.89 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  40 
 
 		 326 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  33.02 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  38.03 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  44.9 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  41.3 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  40 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1325  hypothetical protein  29.31 
 
 		 783 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.2486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  31.2 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  28.1 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  34.21 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  44.44 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  29.66 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6156  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.09 
 
 		 560 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>