38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4980 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  100 
 
 		 604 aa  1254    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  59.93 
 
 		 600 aa  760    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  49 
 
 		 632 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  31.86 
 
 		 817 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  33.48 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.42 
 
 		 803 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.74 
 
 		 608 aa  187  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  28.3 
 
 		 597 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  26.56 
 
 		 607 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  25.43 
 
 		 598 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  26.63 
 
 		 597 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  29.32 
 
 		 491 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  29.06 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.66 
 
 		 612 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  31.53 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  32.09 
 
 		 495 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  31.23 
 
 		 507 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.27 
 
 		 378 aa  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  29.73 
 
 		 522 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  31.47 
 
 		 541 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  27.12 
 
 		 588 aa  101  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  30.06 
 
 		 496 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  28.92 
 
 		 566 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  27.8 
 
 		 487 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  28.87 
 
 		 538 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  27.51 
 
 		 518 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  30.55 
 
 		 551 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  27.08 
 
 		 486 aa  94  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  26.38 
 
 		 590 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  29.72 
 
 		 391 aa  89.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  26.38 
 
 		 600 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  29.25 
 
 		 528 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 		 531 aa  87  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  26.32 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  25.77 
 
 		 544 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.69 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.05 
 
 		 342 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.85 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>