More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2388 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  100 
 
 		 315 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  94.59 
 
 		 315 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  62.22 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  62.78 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  57.14 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  51.8 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  53.4 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  52.61 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  50.16 
 
 		 311 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  51.16 
 
 		 311 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  49.84 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  49.19 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  43.52 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  45.05 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  41.49 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  40.13 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  40 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  40.13 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  44.16 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  42.54 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  41.42 
 
 		 363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  42.59 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  42.27 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  42.27 
 
 		 313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  46.54 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  41.96 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  42.27 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  41.51 
 
 		 345 aa  218  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  42.45 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  44.41 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  36.88 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  37.82 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  40.85 
 
 		 348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  44.12 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  39.1 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  44.01 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  38.44 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  34.6 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  34.6 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  34.17 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.66 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  30.93 
 
 		 328 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.41 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.48 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  30.39 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  27.24 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  31.23 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  27.24 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  27.24 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  27.24 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  27.24 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  27.24 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  27.24 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  26.87 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  28.25 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  30.18 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  26.87 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  27.78 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  26.49 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  29.91 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  31.23 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  31.23 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  31.23 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  31.77 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  30.07 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  30.07 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  30.88 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  27.3 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  27.3 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  31.49 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  27.86 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  28.91 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  25.91 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  27.3 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  31.34 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  26.95 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  26.95 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  27.74 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  27.87 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  32.99 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  32.99 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  27.87 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  32.99 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  27.53 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  31.9 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  27.78 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.46 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.86 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  25.98 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  27.76 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  29.73 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  28.68 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  31.02 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.26 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  28.15 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  26.6 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  25 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  30.43 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.67 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  30.56 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>