42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0310 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  100 
 
 		 109 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  99.08 
 
 		 109 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  68.09 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  66.28 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  55.05 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  65.22 
 
 		 96 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  62.5 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  61.9 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  55.32 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  53.68 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  55.1 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  55.1 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  55.1 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  55.1 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  55.1 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  55.1 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  70.18 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  62.86 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1698  pentapeptide MXKDX repeat protein  40 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  70.18 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2752  pentapeptide MXKDX repeat protein  42.11 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  48.15 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 		 1057 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  55.43 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0621  hypothetical protein  48.72 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1200  pentapeptide MXKDX repeat protein  53.09 
 
 		 74 aa  52.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.611594  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0866  pentapeptide MXKDX repeat protein  58.33 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4053  hypothetical protein  57.35 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2665  pentapeptide MXKDX repeat protein  64.91 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  64 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1106  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  70.59 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1106  hypothetical protein  68.63 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227161  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  60 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3034  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5021  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  57.63 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978776  normal  0.0965687 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  22.22 
 
 		 349 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0017  hypothetical protein  50.7 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  39.29 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0020  hypothetical protein  51.39 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 1435 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  55.32 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>