67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4058 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  69.84 
 
 		 189 aa  274  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  57.14 
 
 		 191 aa  231  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.49 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.13 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  39.13 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.89 
 
 		 362 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.52 
 
 		 202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  37.79 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.57 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.84 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  35.84 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  35.84 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  33.51 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  35.26 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  35.26 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  35.26 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  35.26 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  35.26 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  30.37 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  35.16 
 
 		 200 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  34.39 
 
 		 354 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  35.84 
 
 		 200 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  35.84 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  35.84 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  35.84 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.42 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.39 
 
 		 349 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.95 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  30.57 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  36.08 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  36.48 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.98 
 
 		 287 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  36 
 
 		 364 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.21 
 
 		 225 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5579  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.81 
 
 		 432 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117787  normal  0.0799593 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  32.93 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.18 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2140  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.99 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0238558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  30.15 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  31.01 
 
 		 220 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  29.41 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.23 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.13 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0344  Fic family protein  26.67 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.201398  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  35.78 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.03 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6305  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.01 
 
 		 324 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5375  hypothetical protein  39.71 
 
 		 105 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.392977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3334  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0278  cell division protein  28.57 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0316565  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3724  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.86 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1367  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.54 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3971  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.67 
 
 		 330 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0441  cell filamentation-like protein  26.72 
 
 		 332 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.701812  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  27.92 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1581  mobile mystery protein B  32.53 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.89 
 
 		 293 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2940  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  25.95 
 
 		 430 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.0280417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.1 
 
 		 402 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.48 
 
 		 427 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 248 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.25 
 
 		 243 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.98 
 
 		 222 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  28.28 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>