273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3782 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  100 
 
 		 402 aa  811    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  81.84 
 
 		 440 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  46.54 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  41.56 
 
 		 410 aa  310  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  41.64 
 
 		 400 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  40.51 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  40 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  40.63 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  37.6 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  36.83 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  38.28 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  37.7 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  35.83 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  35.64 
 
 		 388 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  37.6 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  35.12 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  35.37 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  35.69 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  35.69 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  34.85 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  35.56 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  36.25 
 
 		 410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  34.93 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.29 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.29 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  34.29 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.29 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.86 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.32 
 
 		 373 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.32 
 
 		 373 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  36.17 
 
 		 398 aa  205  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  34.64 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  34.76 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  34.23 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  33.87 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  33.87 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  35.21 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  32.98 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  34.11 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  33.07 
 
 		 397 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  31.59 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  33.42 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  31.08 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  31.08 
 
 		 397 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 406 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  34.75 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  32.16 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  32.41 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  30.75 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 384 aa  143  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  30.32 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  29.91 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 385 aa  126  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  29.22 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  29.38 
 
 		 384 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  30.62 
 
 		 417 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.37 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  28.64 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  30.33 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.04 
 
 		 378 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  23.96 
 
 		 378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.85 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.85 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.85 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.85 
 
 		 386 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.85 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  30.59 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  28.73 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.89 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  25.25 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  29.43 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.76 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.53 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  29.19 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  29.32 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  29.04 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  30.16 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.92 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  24.87 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.87 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.87 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.87 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.87 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  24.87 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  24.87 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>