32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0948 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1148    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  70.28 
 
 		 540 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  61.98 
 
 		 563 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  69 
 
 		 564 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  56.01 
 
 		 566 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  57.12 
 
 		 568 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  50.17 
 
 		 563 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  33.41 
 
 		 617 aa  263  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  38.14 
 
 		 528 aa  248  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  37.59 
 
 		 597 aa  247  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  35.7 
 
 		 646 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  35.93 
 
 		 647 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  35.27 
 
 		 546 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  33.85 
 
 		 592 aa  233  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  34.62 
 
 		 590 aa  217  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  31.76 
 
 		 552 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  30.08 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  29.43 
 
 		 423 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  26.52 
 
 		 528 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  26.09 
 
 		 537 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  26.62 
 
 		 512 aa  124  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  26.62 
 
 		 502 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  28.11 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  27.83 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  28.2 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  28.36 
 
 		 511 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  27.99 
 
 		 513 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  23.99 
 
 		 467 aa  98.6  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  24.49 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  25.24 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  23.49 
 
 		 408 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  28.03 
 
 		 380 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>