More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0608 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7602  aspartate kinase  89.45 
 
 		 418 aa  732    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0379  aspartate kinase  86.78 
 
 		 417 aa  726    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0608  aspartate kinase  100 
 
 		 417 aa  848    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0077  aspartate kinase  95.92 
 
 		 417 aa  770    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.0840427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0514  aspartate kinase  93.53 
 
 		 417 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0514405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0099  aspartate kinase  94.96 
 
 		 417 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.211168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0472  aspartate kinase  86.54 
 
 		 417 aa  735    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0110  aspartate kinase  74.04 
 
 		 411 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2625  aspartate kinase  74.64 
 
 		 419 aa  604  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0891  aspartate kinase  72.18 
 
 		 411 aa  598  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4746  aspartate kinase  73.08 
 
 		 411 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0135  aspartate kinase  71.88 
 
 		 411 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0420777  normal  0.197945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0896  aspartate kinase  72.84 
 
 		 411 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  69.95 
 
 		 423 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0921  aspartate kinase  71.88 
 
 		 411 aa  587  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0958  aspartate kinase  71.88 
 
 		 411 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859872  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  69.21 
 
 		 417 aa  577  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  69.63 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1562  aspartate kinase  70.67 
 
 		 411 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3526  aspartate kinase  69.39 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.566908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1802  aspartate kinase  69.95 
 
 		 423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0701255  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1871  aspartate kinase  69.72 
 
 		 423 aa  570  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2504  aspartate kinase  68.94 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3957  aspartate kinase  70.79 
 
 		 424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3818  aspartate kinase  69.74 
 
 		 419 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  66.98 
 
 		 419 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  64.82 
 
 		 405 aa  522  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  65.16 
 
 		 418 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  63.86 
 
 		 406 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  59.33 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  63.29 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3304  aspartate kinase  62.29 
 
 		 418 aa  488  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0250326  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2061  aspartokinase  60.29 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.227299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0636  aspartate kinase  59.1 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0950  aspartate kinase  60.47 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0498  aspartate kinase  59.1 
 
 		 419 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366794  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1849  aspartate kinase  59.1 
 
 		 419 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  58.37 
 
 		 412 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2144  aspartate kinase  61.69 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0884042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0862  aspartate kinase  58.02 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  53.59 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  53.38 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  54.11 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  53.85 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  53.86 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  54.18 
 
 		 408 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  53.61 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  54.09 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  52.76 
 
 		 409 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  53.61 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  53.11 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  53.21 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  53.96 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  52.78 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  53.12 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  53.94 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  53.61 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  53.12 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  53.61 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  52.73 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  55.42 
 
 		 416 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  53.48 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  52.88 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  53.72 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  53.38 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  54.81 
 
 		 409 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  53.1 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  53.57 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  53.62 
 
 		 404 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  52.3 
 
 		 400 aa  408  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  51.57 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  53.27 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  52.88 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  52.17 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  50.6 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  52.61 
 
 		 414 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  52.66 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  54.44 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  54.14 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  53.25 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  51.2 
 
 		 413 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  51.67 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  52.48 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  53.25 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  54.01 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  50.12 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  54.1 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  52.53 
 
 		 410 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  53.64 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1705  aspartate kinase  51.94 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.794446  normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  53.9 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  52.04 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  51.44 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  54.07 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  53.38 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  53.86 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  54.55 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  55.11 
 
 		 416 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  53.61 
 
 		 422 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  53.04 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>