More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4081 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
319 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  40.45 
 
 
319 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  39.03 
 
 
324 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  39.56 
 
 
319 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 
310 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  41.27 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  41.27 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 
366 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  42.16 
 
 
320 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  35.74 
 
 
367 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.54 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  38.54 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  38.22 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  38.54 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  40.51 
 
 
331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.54 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  37.03 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 
364 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
341 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  36.42 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 
332 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1606  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
347 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  39.54 
 
 
365 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  39.02 
 
 
312 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 
319 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  37.29 
 
 
348 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  39.54 
 
 
365 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  39.54 
 
 
365 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
342 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  38.41 
 
 
357 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
312 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  36.93 
 
 
312 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  36.66 
 
 
331 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 
339 aa  225  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  39.93 
 
 
353 aa  225  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.6 
 
 
353 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.6 
 
 
353 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.6 
 
 
353 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  37.94 
 
 
330 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  37.38 
 
 
330 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
383 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  35.46 
 
 
337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  37.03 
 
 
320 aa  222  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
307 aa  222  7e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
363 aa  222  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  36.72 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
330 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 
330 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 
338 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  35.67 
 
 
320 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  35.06 
 
 
346 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  35.67 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 
339 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
343 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 
333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
323 aa  215  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  35.95 
 
 
339 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.87 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  38.69 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.45 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  39.07 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  38.56 
 
 
345 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
334 aa  212  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.18 
 
 
308 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  36.13 
 
 
324 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
327 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  38.08 
 
 
358 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 
359 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0728  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
327 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
336 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0744  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
327 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
312 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
339 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
340 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0218  glycosyltransferase-like protein  40.19 
 
 
330 aa  210  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0486  glycosyltransferase-like protein  40.19 
 
 
330 aa  210  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.518012  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  37.75 
 
 
358 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
347 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 
347 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  38.74 
 
 
347 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 
334 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
373 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  35.43 
 
 
373 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 
347 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 
347 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 
356 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0236  glycosyl transferase family 2  40.07 
 
 
308 aa  208  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.855087  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
327 aa  208  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  38.36 
 
 
319 aa  208  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
360 aa  208  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
383 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 
350 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
348 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  37.75 
 
 
308 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.99 
 
 
319 aa  206  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
309 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>