14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2196 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2196  hypothetical protein  100 
 
 		 966 aa  1962    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852049  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1038 aa  439  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  33.73 
 
 		 1519 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  28.77 
 
 		 909 aa  51.6  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  31.35 
 
 		 983 aa  50.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  27.24 
 
 		 2573 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  27 
 
 		 1118 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  27.12 
 
 		 951 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  26.22 
 
 		 554 aa  46.6  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  25.4 
 
 		 1989 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  30.77 
 
 		 587 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  26.48 
 
 		 924 aa  45.8  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  32.14 
 
 		 2118 aa  45.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.17 
 
 		 4896 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>