76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1898 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1898  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3748  hypothetical protein  42.2 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  24.71 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  24.89 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  24.89 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  24.89 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  24.89 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  24.89 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  24.89 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  24.89 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  25.1 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  24.89 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  24.69 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  24.45 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  25 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  23.9 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  24.36 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  26.5 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  26.5 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  22.55 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  20.94 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  23.71 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  26.64 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  24.47 
 
 		 441 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  24.47 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  24.47 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  24.25 
 
 		 497 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  24.47 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  24.2 
 
 		 329 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  24.47 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  24.2 
 
 		 327 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  24.2 
 
 		 333 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  24 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  24 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  24 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  24 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  22.86 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  22.86 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  22.86 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  22.86 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  22.86 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  22.86 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  24.63 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  24.35 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  21.67 
 
 		 325 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  21.67 
 
 		 325 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  23.4 
 
 		 320 aa  48.9  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  22.22 
 
 		 463 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  27.2 
 
 		 339 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  22.27 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  24.81 
 
 		 314 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  24.81 
 
 		 314 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  24.81 
 
 		 314 aa  45.4  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  24.81 
 
 		 314 aa  45.4  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  24.81 
 
 		 314 aa  45.4  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  22.75 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  24.9 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0690  Integrase catalytic region  21.65 
 
 		 321 aa  42.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  26.57 
 
 		 280 aa  42  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>