15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5937 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  63.35 
 
 		 916 aa  1007    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  100 
 
 		 935 aa  1877    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  33.02 
 
 		 887 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  39.35 
 
 		 1241 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  30.79 
 
 		 935 aa  137  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1120 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  29.76 
 
 		 877 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  30.55 
 
 		 680 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  27.29 
 
 		 809 aa  97.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  33.2 
 
 		 713 aa  95.1  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  26.51 
 
 		 828 aa  92  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  26.01 
 
 		 913 aa  85.1  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  28.68 
 
 		 945 aa  84.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  24.6 
 
 		 869 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  25.83 
 
 		 960 aa  62.4  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>