More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1308 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1308  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
353 aa  731    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277534  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0820  hypothetical protein  78.47 
 
 
353 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.71 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 
351 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 
433 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
389 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1803  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.18 
 
 
392 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.71 
 
 
412 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  31.71 
 
 
412 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  31.71 
 
 
412 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  31.71 
 
 
412 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.69 
 
 
346 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.71 
 
 
412 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.52 
 
 
351 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
346 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
390 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.95 
 
 
412 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.98 
 
 
389 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  35.67 
 
 
352 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  30.95 
 
 
412 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.69 
 
 
412 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.69 
 
 
412 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  30.69 
 
 
412 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.63 
 
 
389 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.69 
 
 
412 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.82 
 
 
387 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1926  alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
393 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.43 
 
 
412 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.89 
 
 
389 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.14 
 
 
390 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5109  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.16 
 
 
392 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5488  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
392 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5197  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
392 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.21 
 
 
376 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.62 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.01 
 
 
393 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.79 
 
 
385 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.87 
 
 
389 aa  199  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.87 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.82 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0372  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.51 
 
 
387 aa  196  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4749  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
393 aa  195  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6610  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34 
 
 
394 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.965415  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.72 
 
 
379 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
391 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 
389 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.05 
 
 
346 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.1 
 
 
389 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  35.67 
 
 
346 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.97 
 
 
411 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.55 
 
 
390 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.95 
 
 
391 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
347 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.71 
 
 
351 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0885  putative glutathione-dependent aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
391 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.418745  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.55 
 
 
390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  30.2 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.21 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.21 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.87 
 
 
388 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1966  alcohol dehydrogenase  33 
 
 
393 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317258  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.4 
 
 
391 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.81 
 
 
390 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.77 
 
 
346 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.69 
 
 
392 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
346 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
386 aa  189  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.72 
 
 
390 aa  188  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
346 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
390 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.83 
 
 
392 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
384 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
400 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
370 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
390 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.89 
 
 
347 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
346 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1589  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.75 
 
 
394 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
346 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 
391 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 
391 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
396 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
390 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.04 
 
 
390 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.06 
 
 
392 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 
393 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
343 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  32.14 
 
 
411 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 
385 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
388 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  29.35 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.85 
 
 
396 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.75 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.75 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.75 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>