24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0323 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  100 
 
 		 342 aa  705    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  34.81 
 
 		 526 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  29.65 
 
 		 513 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  31.45 
 
 		 515 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  26.93 
 
 		 521 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 533 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  27.86 
 
 		 517 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  27.86 
 
 		 517 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  27.86 
 
 		 517 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  30.72 
 
 		 531 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  26.85 
 
 		 579 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.44 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  26.64 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2901  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  24.66 
 
 		 517 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01692  hypothetical protein  28.77 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1846  hypothetical protein  28.77 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0660802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  25.42 
 
 		 434 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4986  Phage integrase  28.08 
 
 		 527 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5179  integrase family protein  32.8 
 
 		 505 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  30.99 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  28 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  28.42 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>