13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2466 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  229  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  43.75 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  40 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  45.21 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  32.63 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  34.52 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  31.58 
 
 		 302 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  38.82 
 
 		 356 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  38.82 
 
 		 257 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  31.58 
 
 		 313 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  32.18 
 
 		 265 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1484  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2207  hypothetical protein  39.58 
 
 		 350 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>