More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1244 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 534 aa  1068    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  41.29 
 
 		 521 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  41.37 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  40.43 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  39.73 
 
 		 521 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  39.73 
 
 		 519 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  38.13 
 
 		 519 aa  354  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  37.62 
 
 		 519 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  37.77 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  37.29 
 
 		 549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  35.55 
 
 		 545 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  35.55 
 
 		 545 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  35.91 
 
 		 544 aa  310  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  34.86 
 
 		 550 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  35.31 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  36.58 
 
 		 513 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  35.65 
 
 		 553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  34.79 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  36.96 
 
 		 505 aa  295  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  37.62 
 
 		 523 aa  287  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  36.04 
 
 		 550 aa  283  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  35.47 
 
 		 513 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  35.16 
 
 		 557 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  34.76 
 
 		 519 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  34.68 
 
 		 532 aa  273  8.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  35.27 
 
 		 545 aa  264  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  34.39 
 
 		 519 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  34.85 
 
 		 510 aa  256  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  32.94 
 
 		 501 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  33.07 
 
 		 502 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  34.92 
 
 		 511 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  32.05 
 
 		 539 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  28.71 
 
 		 531 aa  253  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  34.36 
 
 		 548 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  29.52 
 
 		 531 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  34.92 
 
 		 501 aa  246  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  28.89 
 
 		 531 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  32.42 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  29.12 
 
 		 531 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  30.74 
 
 		 505 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  29.59 
 
 		 506 aa  239  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  31.06 
 
 		 544 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  31.06 
 
 		 544 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  35.53 
 
 		 511 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  31.38 
 
 		 500 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  33.73 
 
 		 502 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  34.86 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  32.89 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  30.06 
 
 		 497 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  32.89 
 
 		 500 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  27.09 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  33.11 
 
 		 500 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  33.11 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  33.56 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  32.44 
 
 		 526 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  32.82 
 
 		 500 aa  203  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  31.77 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.74 
 
 		 502 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.54 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  31.99 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  35.21 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  32.57 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  31.7 
 
 		 520 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  28.21 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  33 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  32.36 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.41 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  31.52 
 
 		 499 aa  190  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.56 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.49 
 
 		 494 aa  188  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  30.49 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  30.49 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  35.85 
 
 		 321 aa  187  6e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  32.6 
 
 		 501 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  30.27 
 
 		 494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  32.08 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.27 
 
 		 494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.27 
 
 		 494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.27 
 
 		 494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.27 
 
 		 494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  29.52 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  32.7 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.27 
 
 		 494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  33.05 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  29.04 
 
 		 520 aa  183  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2106  Ppx/GppA phosphatase  26.23 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000089745  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  30.22 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.11 
 
 		 500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  28.42 
 
 		 501 aa  179  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  31.7 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.21 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.21 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.21 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.21 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.21 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.82 
 
 		 498 aa  177  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.04 
 
 		 498 aa  176  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  30.55 
 
 		 511 aa  176  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  29.67 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>