38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6340 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  82.93 
 
 		 205 aa  357  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  45.85 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  47.25 
 
 		 187 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  46.19 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  44.72 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  45.36 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  47.31 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  37.81 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  39.11 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  40.8 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  37.81 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  36.36 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  35.83 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  35.83 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  35.29 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  35.29 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  32 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  36.26 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  32.79 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  31.11 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  32.76 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  31.61 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  29.32 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  34.29 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  28.9 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  22.16 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  25.49 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  22.03 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  31.43 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  28.26 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  29.46 
 
 		 276 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1712  hypothetical protein  32.45 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  26.76 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13950  hypothetical protein  21.76 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0490  hypothetical protein  31.82 
 
 		 89 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.3339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>