56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5934 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5934  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
380 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3974  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.11 
 
 
363 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301778  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0249  2OG-Fe(II) oxygenase  38.19 
 
 
325 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1514  putative hydroxylase  36.54 
 
 
229 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3334  putative hydroxylase  41.18 
 
 
229 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0690816  normal  0.437526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2089  putative hydroxylase  40.2 
 
 
229 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1313  putative hydroxylase  30.65 
 
 
209 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325019  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3968  putative hydroxylase  38.6 
 
 
229 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3541  putative hydroxylase  37.93 
 
 
229 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0838  putative hydroxylase  29.67 
 
 
228 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3637  putative hydroxylase  40.23 
 
 
228 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4677  putative hydroxylase  41.77 
 
 
227 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000773199  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1130  putative hydroxylase  43.75 
 
 
227 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0045  putative hydroxylase  38.96 
 
 
227 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12420  putative hydroxylase  37.36 
 
 
226 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.455137  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0612  2OG-Fe(II) oxygenase  42.31 
 
 
226 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12340  putative hydroxylase  33.04 
 
 
226 aa  49.7  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0799  putative hydroxylase  37.36 
 
 
226 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3048  putative hydroxylase  38.75 
 
 
227 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1949  2OG-Fe(II) oxygenase  36.71 
 
 
227 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2559  putative hydroxylase  45.61 
 
 
227 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2812  putative hydroxylase  36.36 
 
 
226 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.192542  decreased coverage  0.000000224129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58580  putative hydroxylase  34.07 
 
 
226 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00121484  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1523  2OG-Fe(II) oxygenase  37.1 
 
 
259 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5374  putative hydroxylase  28.57 
 
 
227 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983229  normal  0.422627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0236  2OG-Fe(II) oxygenase  32.56 
 
 
226 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.740629  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0862  putative hydroxylase  35.16 
 
 
226 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0905  putative hydroxylase  36.26 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5129  putative hydroxylase  34.07 
 
 
242 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1262  putative hydroxylase  22.92 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3803  putative hydroxylase  26.9 
 
 
228 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4316  putative hydroxylase  36.26 
 
 
226 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0120702 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3916  putative hydroxylase  26.9 
 
 
228 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.721944  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0892  putative hydroxylase  36.71 
 
 
227 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132513  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0228  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.73 
 
 
151 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.496244  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4722  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
155 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0892  putative hydroxylase  24.46 
 
 
226 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.137748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3725  hypothetical protein  31.71 
 
 
251 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.780792 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3575  putative hydroxylase  41.67 
 
 
227 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.574336 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4479  putative hydroxylase  41.67 
 
 
227 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7102  putative hydroxylase  43.48 
 
 
227 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5004  putative hydroxylase  25.97 
 
 
227 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0377  putative hydroxylase  39.13 
 
 
226 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925919  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5473  putative hydroxylase  36.71 
 
 
227 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632728 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13621  putative hydroxylase  21.77 
 
 
222 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.436442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1709  putative hydroxylase  41.18 
 
 
230 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.822877  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4810  putative hydroxylase  36.71 
 
 
227 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63397  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3793  putative hydroxylase  36.71 
 
 
227 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3557  putative hydroxylase  36.71 
 
 
227 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0219  putative hydroxylase  43.48 
 
 
227 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4714  putative hydroxylase  36.71 
 
 
227 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.730869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3084  putative hydroxylase  32.53 
 
 
227 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.418159  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1201  putative hydroxylase  36.78 
 
 
227 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1638  putative hydroxylase  41.18 
 
 
230 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4192  putative hydroxylase  36.71 
 
 
227 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540469  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2877  putative hydroxylase  35.44 
 
 
228 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>