More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5170 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  100 
 
 
285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  90.43 
 
 
285 aa  520  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  63.31 
 
 
295 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  62.95 
 
 
295 aa  361  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  63.67 
 
 
297 aa  359  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  64 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  60.57 
 
 
279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  61.13 
 
 
287 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  61.15 
 
 
279 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  61.01 
 
 
287 aa  345  6e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  61.17 
 
 
276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  58.21 
 
 
285 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  62.14 
 
 
291 aa  335  5e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  60.95 
 
 
277 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  61.73 
 
 
276 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  60.73 
 
 
277 aa  332  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  60.44 
 
 
277 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  58.91 
 
 
277 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  60.44 
 
 
277 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  59.21 
 
 
276 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  59.01 
 
 
284 aa  326  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  59.21 
 
 
280 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  58.33 
 
 
276 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  58.61 
 
 
274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  58.61 
 
 
274 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  54.61 
 
 
292 aa  311  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  58.24 
 
 
274 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  54.23 
 
 
296 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  54.32 
 
 
297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  56.57 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  54.93 
 
 
304 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  55.52 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  55.76 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  56.12 
 
 
304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  53.36 
 
 
291 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  53.87 
 
 
304 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  53.87 
 
 
304 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  53.87 
 
 
304 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  56.36 
 
 
281 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  53.71 
 
 
293 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  54.06 
 
 
293 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  54.06 
 
 
293 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  54.06 
 
 
293 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  54.06 
 
 
293 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  55.64 
 
 
286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  53.71 
 
 
293 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  54.38 
 
 
276 aa  285  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  53.71 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  51.44 
 
 
291 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  44.81 
 
 
283 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  45.32 
 
 
278 aa  241  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  47.64 
 
 
274 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  49.24 
 
 
276 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1864  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429685  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.52 
 
 
342 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2643  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.39 
 
 
327 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.791522  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 
353 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.64 
 
 
353 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 
325 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4407  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.2 
 
 
329 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.89 
 
 
371 aa  229  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  44.96 
 
 
538 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  44.36 
 
 
333 aa  228  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0687438  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.72 
 
 
671 aa  228  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 
347 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2471  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
329 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.595085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4393  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 
338 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4234  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
338 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4733  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 
338 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
338 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.52 
 
 
330 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4246  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
338 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0764  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 
392 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2923  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.59 
 
 
328 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
347 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
347 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 
347 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
347 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
347 aa  225  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 
347 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
347 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
347 aa  225  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
347 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0452  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 
332 aa  225  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 
346 aa  225  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.403514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0825  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
330 aa  225  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2059  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 
694 aa  225  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1003  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
330 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0810  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
330 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0999  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
330 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  44.85 
 
 
686 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
539 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4383  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.77 
 
 
330 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.0305999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.52 
 
 
329 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 
348 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0785342  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 
330 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
347 aa  222  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0948  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
330 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>