47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4578 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  77 
 
 		 426 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  77.86 
 
 		 425 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  96.46 
 
 		 424 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  62.83 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  59.95 
 
 		 441 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  59.95 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  60.95 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  57.76 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  59.47 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  59.67 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  60.4 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  54.29 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  51.17 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  54.12 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  54.38 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  54.64 
 
 		 443 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  50.12 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  52.19 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  50.86 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  54.38 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  50.77 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  54.12 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  51.98 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  53.17 
 
 		 452 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  50.9 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  53.44 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  49.87 
 
 		 475 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  49.49 
 
 		 446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  41.81 
 
 		 428 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  43.08 
 
 		 486 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  40.92 
 
 		 480 aa  257  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  40 
 
 		 482 aa  256  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  40.35 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  39.53 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  39.46 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  39.43 
 
 		 407 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  38.44 
 
 		 400 aa  215  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  36.81 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  37.35 
 
 		 356 aa  53.5  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  25.99 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  22.8 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  23.48 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  20.76 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  21.66 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  21.82 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  28.43 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>