More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2253 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2253  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 488 aa  993    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3130  carbohydrate kinase FGGY  68.34 
 
 		 489 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2031  carbohydrate kinase FGGY  89.75 
 
 		 488 aa  900    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0853026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2403  glycerol kinase, putative  45.23 
 
 		 491 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2645  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  44.17 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289536  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3247  carbohydrate kinase  42.3 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3381  carbohydrate kinase FGGY  42.3 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  38.83 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  39.56 
 
 		 496 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3522  carbohydrate kinase FGGY  42.42 
 
 		 504 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0291  glycerol kinase  40.44 
 
 		 496 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807518  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0907  glycerol kinase  41.19 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2143  carbohydrate kinase FGGY  38.99 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628081  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  40.7 
 
 		 483 aa  345  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  39.22 
 
 		 489 aa  343  4e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  40.13 
 
 		 496 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3636  carbohydrate kinase FGGY  42.08 
 
 		 503 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  39.47 
 
 		 492 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0962  glycerol kinase  39.75 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  39.47 
 
 		 492 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2442  carbohydrate kinase, FGGY  39.14 
 
 		 494 aa  339  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0259159  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  38.34 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  39.26 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  37.32 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  37.32 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  37.65 
 
 		 479 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  37.53 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  37.32 
 
 		 496 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  37.32 
 
 		 496 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  40.25 
 
 		 498 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  37.32 
 
 		 496 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2590  glycerol kinase  40.33 
 
 		 483 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0112292  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21570  glycerol kinase  39.72 
 
 		 503 aa  336  5e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1515  glycerol kinase  39.54 
 
 		 484 aa  336  5e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  40.29 
 
 		 503 aa  336  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  37.32 
 
 		 496 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  38.99 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  40.89 
 
 		 496 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  38.48 
 
 		 510 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  38.55 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  37.27 
 
 		 501 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  37.17 
 
 		 499 aa  333  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  40.09 
 
 		 507 aa  333  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0140  glycerol kinase  40.46 
 
 		 493 aa  331  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0145191  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  39.6 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  37.6 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  39.57 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  36.89 
 
 		 499 aa  330  4e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  37.6 
 
 		 500 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  39.14 
 
 		 502 aa  329  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1940  glycerol kinase  39.79 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2805  carbohydrate kinase FGGY  36.71 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  38.69 
 
 		 513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  36.55 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  39.6 
 
 		 505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  37.2 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  39.38 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  36.53 
 
 		 494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  36.84 
 
 		 498 aa  327  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  39.38 
 
 		 500 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2595  glycerol kinase  37.61 
 
 		 498 aa  326  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  39.38 
 
 		 500 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  39.38 
 
 		 500 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  39.38 
 
 		 500 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  39.23 
 
 		 501 aa  325  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  41.49 
 
 		 496 aa  325  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  37.53 
 
 		 492 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  39.16 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5747  glycerol kinase  41.28 
 
 		 488 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259749  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2082  glycerol kinase  41.34 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  37.14 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  39.6 
 
 		 499 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  37.63 
 
 		 502 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  39.1 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  40.43 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  39.57 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  39.38 
 
 		 518 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  39.38 
 
 		 518 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  39.38 
 
 		 518 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  39.38 
 
 		 518 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  39.38 
 
 		 518 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  39.51 
 
 		 496 aa  322  8e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  39.38 
 
 		 503 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  39.38 
 
 		 503 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  39.38 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  39.36 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  38.87 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  38.25 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  37.22 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  37.22 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  37.22 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  37.22 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  37.22 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  37.22 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  37.22 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  39.27 
 
 		 495 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  37.22 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  41.81 
 
 		 495 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  37.22 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  40.97 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>