19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4401 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1097    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2575  hypothetical protein  27.83 
 
 
506 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  25 
 
 
423 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  26.28 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  26.28 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  26.28 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  45.31 
 
 
412 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  24.92 
 
 
423 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  39.53 
 
 
409 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  25.09 
 
 
422 aa  53.9  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  23.59 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  23.79 
 
 
423 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  26.94 
 
 
414 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  26.51 
 
 
418 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2113  hypothetical protein  25.68 
 
 
314 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  43.86 
 
 
356 aa  47.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  37.18 
 
 
455 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  39.47 
 
 
381 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  41.43 
 
 
298 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>