37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3004 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 131 aa  249  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  93.89 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  63.83 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  62.5 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  59.85 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  64.38 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  63.01 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  60.61 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  56.82 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  53.62 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  38.46 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  55.93 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  55.07 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  48.57 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  56.52 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  49.41 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  39.53 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  46.28 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  38.37 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  38.3 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  39.36 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  36.47 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  36.51 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  36.51 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  44.29 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  44.29 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  45.45 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  43.06 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  49.28 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  38.81 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  36.56 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  45.59 
 
 		 210 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  50 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  57.89 
 
 		 264 aa  42  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  38.16 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  34.34 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>