26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2012 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  96.61 
 
 
187 aa  342  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  60.84 
 
 
180 aa  197  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  62.99 
 
 
187 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  53.21 
 
 
178 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  53.21 
 
 
178 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  54.14 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  41.95 
 
 
180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  29.88 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  33.03 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  27.13 
 
 
175 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  31.19 
 
 
169 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  25.18 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  26.81 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  26.43 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  32.5 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  39.62 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  25.52 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  39.62 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  39.62 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  26.28 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  26.28 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>