35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4354 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4354  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 813 aa  1659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2699  Rad3-related DNA helicase-like protein  26.96 
 
 		 766 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.59552  normal  0.502063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1037  CRISPR-associated DEAD/DEAH-box helicase Csf4  23.62 
 
 		 769 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  24.61 
 
 		 667 aa  57.8  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  21.72 
 
 		 709 aa  56.6  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  28.78 
 
 		 645 aa  52  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.72 
 
 		 966 aa  51.2  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  41.57 
 
 		 666 aa  51.2  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  25.29 
 
 		 765 aa  48.9  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.94 
 
 		 930 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  36.79 
 
 		 675 aa  47.8  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  36.79 
 
 		 675 aa  47.8  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  36.27 
 
 		 649 aa  47.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  30.05 
 
 		 929 aa  47.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  28.15 
 
 		 647 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  25 
 
 		 685 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  22.93 
 
 		 690 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  30.77 
 
 		 846 aa  45.8  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  28.03 
 
 		 641 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  28.03 
 
 		 641 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  27.54 
 
 		 639 aa  45.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  36.94 
 
 		 675 aa  45.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3242  helicase c2  31.13 
 
 		 740 aa  45.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  28.77 
 
 		 645 aa  45.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  27.41 
 
 		 668 aa  45.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  34.74 
 
 		 954 aa  45.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  29.33 
 
 		 640 aa  45.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.02 
 
 		 944 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  30.67 
 
 		 649 aa  45.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  29.94 
 
 		 651 aa  44.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  34.48 
 
 		 681 aa  44.3  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  31.47 
 
 		 634 aa  44.3  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  44.59 
 
 		 646 aa  44.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  31.47 
 
 		 634 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  31.47 
 
 		 634 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>