More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3698 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3698  CBS  100 
 
 		 288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4763  CBS domain containing protein  78.52 
 
 		 292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4185  CBS domain-containing protein  76.57 
 
 		 294 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  76.41 
 
 		 284 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0439  CBS domain-containing protein  73.85 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1271  CBS domain-containing protein  75.44 
 
 		 307 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0539  CBS domain containing protein  71.38 
 
 		 292 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2157  CBS domain-containing protein  71.63 
 
 		 291 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0523  CBS domain-containing protein  71.02 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0257168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3833  CBS domain-containing protein  62.67 
 
 		 306 aa  358  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3385  transport protein  60.75 
 
 		 306 aa  349  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.428811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  49.82 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  50.18 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  49.82 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  49.82 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  49.82 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  49.82 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  49.82 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.39 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.39 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.39 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.39 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  49.45 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.39 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.39 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.39 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  49.46 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  49.45 
 
 		 403 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  46.53 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  48.71 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  47.5 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  47.86 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  48.42 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  47.14 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  43.42 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  45.45 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  46.25 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  41.03 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  44.2 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  43.22 
 
 		 279 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 279 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 279 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  43.58 
 
 		 284 aa  214  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  43.43 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  44.57 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  41.52 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  41.16 
 
 		 323 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0648  CBS  42.65 
 
 		 286 aa  212  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  41.75 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  43.19 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  40.81 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  41.76 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00451  polar amino acid transporter  45.85 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0391689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  43.43 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.16 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  42.7 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  40.07 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  43.38 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  43.01 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  44.57 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  40.66 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  38.65 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  40.14 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  42.59 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  38.65 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.07 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  39.48 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  38.01 
 
 		 292 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  39.71 
 
 		 292 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  37.64 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  40 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.24 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  38.97 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  41.6 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  41.99 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  42.8 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1216  transporter-associated region  42.61 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.14368  normal  0.614507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  40.3 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  40.07 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  43.22 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  40.07 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00626  predicted ion transport  41.92 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2968  transporter-associated region  41.92 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.386789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0705  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.92 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.505842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0751  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.92 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.062635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00617  hypothetical protein  41.92 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0589  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.92 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.315177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0680  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.92 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0687  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.92 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00083151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2987  transporter-associated region  41.92 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>