38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1718 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  838    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  57.41 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  57.28 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  58.27 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  55.98 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  55.9 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  53.25 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  52.06 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  56.87 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  41.59 
 
 		 415 aa  253  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  41.03 
 
 		 415 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  28.14 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  28.14 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  28.64 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  26.98 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  28.81 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  28.81 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  28.81 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  28.7 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  27.36 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  27.59 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  27.59 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  27.36 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  27.36 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  27.36 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  27.36 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  27.36 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  28.7 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  30.82 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  28.87 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  27.41 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  35.71 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  33.93 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  33.93 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  32.14 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  25.52 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  27.09 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  26.22 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>