More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1476 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1476  CheW protein  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.331722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  58.79 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3125  CheW protein  62.13 
 
 		 169 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  59.88 
 
 		 166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  63.01 
 
 		 162 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  53.53 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  58.13 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  55.06 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1759  putative CheW protein  66.44 
 
 		 168 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1963  CheW protein  66.44 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  58.17 
 
 		 162 aa  187  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  58.17 
 
 		 162 aa  187  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  55.95 
 
 		 162 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  60.84 
 
 		 163 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  60.84 
 
 		 163 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  60.14 
 
 		 163 aa  180  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  59.57 
 
 		 162 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  54.65 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  54.65 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  54.65 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  54.65 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  54.65 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  54.65 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  57.86 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  52.3 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  57.24 
 
 		 167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  59.06 
 
 		 158 aa  178  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  54.84 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  50.29 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  55.56 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  53.75 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  53.06 
 
 		 163 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  53.75 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  53.75 
 
 		 177 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  53.75 
 
 		 177 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  54.9 
 
 		 174 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  53.12 
 
 		 171 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  54.36 
 
 		 165 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  54.36 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  54.36 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  54.36 
 
 		 170 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.79 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  54.43 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  54.79 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  57.04 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  55.86 
 
 		 160 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  57.53 
 
 		 164 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  52.53 
 
 		 175 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  53.52 
 
 		 160 aa  168  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  51.16 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  52.5 
 
 		 171 aa  168  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  55.56 
 
 		 174 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  49.69 
 
 		 170 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  53.38 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  53.38 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  53.38 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  53.38 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  53.38 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  53.38 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  52.63 
 
 		 170 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  53.38 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  53.38 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  54.86 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  54.86 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  54.86 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  54.86 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  54.86 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  54.86 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  54.86 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  55.56 
 
 		 167 aa  167  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  48.82 
 
 		 178 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  52.63 
 
 		 170 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  51.61 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  54.17 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  53.06 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  52.26 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  52.9 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  53.06 
 
 		 165 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  54.17 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  54.17 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  54.17 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  54.17 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  54.17 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  52.26 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  52.26 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  54.17 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  51.3 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  49.32 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  49.32 
 
 		 169 aa  160  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  50.72 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0257  putative purine-binding chemotaxis protein  54.19 
 
 		 161 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02230  putative purine-binding chemotaxis protein  54.19 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  49.3 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  46.2 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  41.26 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  47.86 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  42.35 
 
 		 205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24350  Chemotaxis protein  53.95 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  47.1 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  46.81 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>