27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6443 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  99.71 
 
 		 343 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  81.57 
 
 		 335 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0020  hypothetical protein  35.58 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4218  hypothetical protein  34.35 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2343  hypothetical protein  35.34 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.671836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2713  hypothetical protein  33.43 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0140872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  31.07 
 
 		 207 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2361  hypothetical protein  33.82 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206277  hitchhiker  0.0000361585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  31.64 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  35.41 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  27.21 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1412  hypothetical protein  48.09 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0007  TlpA  29.11 
 
 		 371 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.21191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  36.64 
 
 		 205 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  25.58 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1497  mucin-associated surface protein  34.87 
 
 		 281 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000680781 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  24.8 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  28.18 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  35.62 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5039  hypothetical protein  63.49 
 
 		 102 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5355  DNA-binding protein KrfA  33.33 
 
 		 213 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  36.49 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  29.03 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  30.43 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1803  hypothetical protein  34.94 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000895551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  43.18 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>