35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3788 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  79.77 
 
 		 359 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  79.88 
 
 		 346 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  79.3 
 
 		 346 aa  564  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  79.59 
 
 		 346 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  79.3 
 
 		 346 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  76.65 
 
 		 346 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  74.34 
 
 		 361 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  72.59 
 
 		 361 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  68.01 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  56.73 
 
 		 350 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  56.73 
 
 		 350 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  56.14 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  56.43 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  56.14 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  45.4 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  32.35 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  25.37 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  27.73 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  27.72 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  28.5 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  29.26 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  27.36 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  28.76 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  27.45 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  27.54 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  28.73 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  24.41 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  25.93 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  25.56 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3024  hypothetical protein  27.37 
 
 		 374 aa  46.2  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0659  hypothetical protein  24.64 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120549  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2684  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  22.49 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  24.21 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3641  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  27.78 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>