50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2344 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  75.11 
 
 
225 aa  342  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  59.29 
 
 
227 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  56.22 
 
 
233 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  57.39 
 
 
230 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  57.39 
 
 
230 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  58.26 
 
 
230 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  57.58 
 
 
231 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  57.58 
 
 
256 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  56.09 
 
 
230 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  57.58 
 
 
231 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  55.26 
 
 
289 aa  236  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  57.02 
 
 
264 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  57.02 
 
 
227 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  57.02 
 
 
227 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  57.02 
 
 
227 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  57.02 
 
 
264 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  57.02 
 
 
227 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  56.58 
 
 
227 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  46.4 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  38.84 
 
 
212 aa  138  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  39.11 
 
 
239 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  40.72 
 
 
215 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  43.44 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  42.22 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  38.12 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  34.22 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  35.78 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  43.98 
 
 
204 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  40.21 
 
 
212 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  34.48 
 
 
238 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  36.93 
 
 
230 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  40.54 
 
 
200 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  34.63 
 
 
222 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  37.33 
 
 
212 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  36.29 
 
 
245 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  36.09 
 
 
250 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  39.64 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  45.36 
 
 
167 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  35.68 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1316  hypothetical protein  35.79 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  23.98 
 
 
512 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1359  hypothetical protein  29.53 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000393544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4303  hypothetical protein  29.44 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0361171  normal  0.12147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  29.94 
 
 
267 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  44.59 
 
 
263 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06030  hypothetical protein  35.51 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  42.86 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  29.7 
 
 
229 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>