26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1212 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  51.15 
 
 
176 aa  193  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  52.57 
 
 
176 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  52.57 
 
 
176 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  50.86 
 
 
176 aa  178  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  59.57 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  34.29 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  31.48 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  34.16 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  31.61 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  29.17 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  30.49 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1510  hypothetical protein  41.67 
 
 
72 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  27.18 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  28.85 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  25 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  27.56 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  27.59 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  27.27 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  27.46 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  27.59 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  25.81 
 
 
160 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  24 
 
 
141 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  27.72 
 
 
173 aa  40.8  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  26.36 
 
 
196 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>