27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0698 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  78.16 
 
 
203 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  82.7 
 
 
206 aa  313  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  76.35 
 
 
201 aa  310  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  77.6 
 
 
201 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  61.67 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  57.75 
 
 
190 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  59.24 
 
 
189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  62.68 
 
 
190 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  58.86 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  58.23 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  38.03 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  32.19 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  32.54 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  35.96 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  34.19 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  35.9 
 
 
234 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  31.37 
 
 
271 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  31.55 
 
 
216 aa  54.7  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1848  hypothetical protein  28.75 
 
 
168 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.201777 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  31.61 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  32.29 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  27.52 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  30.13 
 
 
320 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  34.92 
 
 
247 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>