14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2642 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  90.42 
 
 		 240 aa  424  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  34.93 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  36.76 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  34.72 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  34.95 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  35.92 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  34.75 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  41.03 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  31.55 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  37.66 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  31.55 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  31.55 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  32.03 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>