14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0761 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  83.13 
 
 		 415 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  807    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  30.74 
 
 		 520 aa  96.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  30.03 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  31.42 
 
 		 636 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  27.82 
 
 		 634 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  32.39 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  31.71 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  36.27 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  34.42 
 
 		 714 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  33.77 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  26.92 
 
 		 355 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  24.54 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  27.8 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>