295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0434 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
305 aa  578  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4203  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  90.82 
 
 
305 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.233468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2163  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  67.32 
 
 
306 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0104507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.55 
 
 
306 aa  261  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.17 
 
 
303 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.94 
 
 
241 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.34 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.25 
 
 
242 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5557  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.97 
 
 
286 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354841  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.44 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.44 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  34.65 
 
 
251 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.25 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  35.95 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.99 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.95 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24340  cytochrome c biogenesis protein  34.03 
 
 
271 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1347  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.71 
 
 
301 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.84 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.3 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  34.14 
 
 
248 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.34 
 
 
247 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.19 
 
 
218 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.78 
 
 
237 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  28.86 
 
 
242 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.83 
 
 
243 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4562  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35 
 
 
291 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0455  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.65 
 
 
259 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.25 
 
 
238 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.47 
 
 
266 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.54 
 
 
399 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.95 
 
 
251 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.87 
 
 
243 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.42 
 
 
238 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  31.38 
 
 
244 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.64 
 
 
237 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.32 
 
 
251 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.58 
 
 
244 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.47 
 
 
249 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.78 
 
 
240 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.54 
 
 
247 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.19 
 
 
222 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.67 
 
 
249 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.51 
 
 
403 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.93 
 
 
253 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.45 
 
 
244 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.73 
 
 
244 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.53 
 
 
244 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.45 
 
 
403 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.68 
 
 
249 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.68 
 
 
249 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.68 
 
 
249 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.51 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.04 
 
 
227 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.29 
 
 
246 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.65 
 
 
245 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.32 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0573  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.5 
 
 
244 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.98 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1522  cytochrome c biogenesis protein  31.28 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00325926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.11 
 
 
247 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4260  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.06 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  31.56 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  36.36 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2451  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.4 
 
 
242 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0258924  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2146  cytochrome c biogenesis protein  39.67 
 
 
402 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0617125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.05 
 
 
245 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  31.15 
 
 
248 aa  93.2  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  31.15 
 
 
253 aa  92.8  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.53 
 
 
224 aa  92  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.27 
 
 
244 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3645  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.66 
 
 
249 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.75 
 
 
227 aa  92  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2222  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.75 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1037  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.58 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.56 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  31.17 
 
 
240 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1426  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.75 
 
 
222 aa  90.5  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  30 
 
 
244 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.68 
 
 
398 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17960  cytochrome c biogenesis protein  33.73 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3920  hypothetical protein  31.3 
 
 
245 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.242157 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  36.47 
 
 
222 aa  89  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.47 
 
 
222 aa  89  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2005  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.54 
 
 
243 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0109812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.71 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.71 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.1 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1735  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.55 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0017  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.62 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.629435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  32.26 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.74 
 
 
270 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.55 
 
 
249 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0107253  normal  0.0935578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.16 
 
 
222 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10538  cytochrome C-type biogenesis protein ccdA  30.16 
 
 
259 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000404989  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.13 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.38 
 
 
225 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0184  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.26 
 
 
281 aa  85.9  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.73 
 
 
244 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>