More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0209 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 310 aa  614  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  79.74 
 
 		 310 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  39.53 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.01 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  34.11 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33.44 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  30.07 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.89 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  29.58 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  28.81 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  30.49 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  28.16 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  29.77 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  29.77 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5797  PfkB domain protein  36.07 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  25.87 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  28 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  28.47 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  35.23 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  27.51 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  35.29 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  29.62 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  29.62 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  29.62 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  35.33 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  29.62 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  27.8 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  30.65 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  28.81 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  30.37 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  30.65 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  28.82 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.38 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  30.65 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  28.53 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29.27 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  25.26 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  30.32 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  34.46 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  28.47 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  25.41 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  30.46 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  30.32 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  29.23 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  31.37 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  28.22 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  30.91 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  28.38 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.27 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  32.99 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  34.88 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  29.02 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  28.27 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  34.14 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  34.2 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  35.62 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  34.34 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  33.81 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  34.14 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  35.27 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  33.8 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  31.7 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  31.75 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  28.71 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  28.71 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  28.71 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  28.71 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  28.71 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  26.9 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  28.71 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  24.11 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  26.35 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  32 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  32 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  28.75 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  32.34 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  28.71 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  28.39 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  30.13 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  27.53 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>