76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0277 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1543  trehalase  70.97 
 
 		 607 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0075  trehalase  70.97 
 
 		 564 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4864  Alpha,alpha-trehalase  67.27 
 
 		 572 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4237  Alpha,alpha-trehalase  66.67 
 
 		 584 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.289952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5350  Alpha,alpha-trehalase  65.52 
 
 		 557 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0995  trehalase  71.57 
 
 		 623 aa  703    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3502  Alpha,alpha-trehalase  67.27 
 
 		 572 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0908  trehalase  71.57 
 
 		 565 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1752  trehalase  69.65 
 
 		 562 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0851  Alpha,alpha-trehalase  67.07 
 
 		 578 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0110483 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2235  trehalase  70.62 
 
 		 566 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5280  Alpha,alpha-trehalase  67.9 
 
 		 574 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  0.173733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4760  Alpha,alpha-trehalase  67.21 
 
 		 576 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5421  Alpha,alpha-trehalase  67.6 
 
 		 572 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0889031  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1166  trehalase  70.97 
 
 		 564 aa  703    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286501  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0277  periplasmic alpha,alpha-trehalase signal peptide protein  100 
 
 		 551 aa  1125    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3734  Alpha,alpha-trehalase  64.88 
 
 		 575 aa  666    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  0.116686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  60.16 
 
 		 568 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  58.75 
 
 		 545 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  56.21 
 
 		 565 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  56.21 
 
 		 565 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  56.21 
 
 		 565 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  56.21 
 
 		 565 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  56.21 
 
 		 565 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  56.21 
 
 		 565 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  56.02 
 
 		 565 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  58.38 
 
 		 561 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0217  trehalase  59.51 
 
 		 568 aa  568  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  56.68 
 
 		 570 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  56.87 
 
 		 570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  57.06 
 
 		 569 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1337  trehalase  56.68 
 
 		 570 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1522  trehalase  56.87 
 
 		 570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  56.65 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0144  Alpha,alpha-trehalase  52.08 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  54.05 
 
 		 536 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  50.69 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  50.69 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  50.5 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  50.5 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  50.5 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  50.69 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  50.5 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  50.5 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  50.69 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2671  Alpha,alpha-trehalase  46.99 
 
 		 516 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  49.7 
 
 		 549 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  52.06 
 
 		 588 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  50.1 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  50.1 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  50.1 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  50.1 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  50.1 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  47.62 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  45.61 
 
 		 537 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  49.29 
 
 		 733 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  45.25 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  42.04 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  40.33 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  44.06 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38852  predicted protein  31.94 
 
 		 593 aa  233  5e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.569718 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  32.93 
 
 		 509 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  32.21 
 
 		 510 aa  188  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  34.44 
 
 		 529 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  32.21 
 
 		 514 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  32.21 
 
 		 514 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  33.26 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 495 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  30.52 
 
 		 544 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00690  trehalase precursor, putative  27.85 
 
 		 691 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.689154  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  30.68 
 
 		 811 aa  142  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  28.06 
 
 		 621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  28.73 
 
 		 751 aa  127  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02790  alpha,alpha-trehalase, putative  28.79 
 
 		 875 aa  124  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347405  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5255  neutral trehalase-like protein  58.21 
 
 		 96 aa  74.3  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  23.31 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>