More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4052 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  100 
 
 		 469 aa  910    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  77.58 
 
 		 466 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  58.61 
 
 		 465 aa  438  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  50 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.71 
 
 		 517 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  49.44 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.66 
 
 		 474 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.32 
 
 		 474 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  42.61 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.25 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  47.79 
 
 		 510 aa  354  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  45.97 
 
 		 481 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.74 
 
 		 474 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.69 
 
 		 472 aa  346  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.92 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  47.79 
 
 		 499 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.5 
 
 		 484 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  46.68 
 
 		 483 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  45.53 
 
 		 477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  43.14 
 
 		 477 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  43.14 
 
 		 477 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  42.92 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  40.86 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  42.48 
 
 		 477 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.25 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  50.76 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  42.52 
 
 		 467 aa  317  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.73 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  42.32 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.64 
 
 		 1553 aa  275  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  27.48 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  28.06 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  27.56 
 
 		 449 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  30.04 
 
 		 459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  27.16 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  27.56 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  26.58 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0030  phosphoglucosamine mutase  24.48 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000444071  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  28.57 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  25.61 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  25.11 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  26.23 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.75 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  26.92 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  32.63 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  26.36 
 
 		 448 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  27.2 
 
 		 448 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0897  phosphoglucosamine mutase  26.01 
 
 		 432 aa  100  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.05706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  28.09 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3596  phosphoglucosamine mutase  30.06 
 
 		 467 aa  99.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  31.38 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  27.16 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  26.83 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  26.58 
 
 		 448 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  28.11 
 
 		 483 aa  97.1  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  26.69 
 
 		 447 aa  97.1  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  31.12 
 
 		 445 aa  97.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  27.85 
 
 		 447 aa  96.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  27.66 
 
 		 451 aa  96.7  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  27.66 
 
 		 451 aa  96.7  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  27.31 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  30.48 
 
 		 448 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  29.39 
 
 		 447 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0209  phosphoglucosamine mutase  28.54 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  24.95 
 
 		 449 aa  93.2  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  27.93 
 
 		 465 aa  93.2  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0871  phosphoglucosamine mutase  27.49 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  29.54 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  26.64 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  28.53 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  30.66 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23210  phosphoglucosamine mutase  29.45 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0474709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  28.14 
 
 		 443 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  30.86 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0764  phosphoglucosamine mutase  25.06 
 
 		 427 aa  91.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.882404  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  29.32 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  25.2 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2223  phosphoglucosamine mutase  28.41 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  24.69 
 
 		 453 aa  90.1  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  90.5  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  29.05 
 
 		 447 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  90.1  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  28.01 
 
 		 454 aa  90.1  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0512  Phosphoglucosamine mutase  29.71 
 
 		 460 aa  90.1  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  31.66 
 
 		 444 aa  89.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1578  phosphoglucosamine mutase  26.71 
 
 		 436 aa  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.840977  normal  0.129452 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1152  phosphoglucosamine mutase  24.95 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00023632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  29.45 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.39 
 
 		 418 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1359  phosphoglucosamine mutase  27.52 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  28.48 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0740  phosphoglucosamine mutase  25.56 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>