38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0751 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  336  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  97.42 
 
 
155 aa  307  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  81.44 
 
 
167 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  70.8 
 
 
155 aa  205  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  69.34 
 
 
150 aa  203  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  73.72 
 
 
146 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  57.24 
 
 
158 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  51.15 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  43.42 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  50 
 
 
161 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  49.21 
 
 
174 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  51.49 
 
 
161 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  50.38 
 
 
180 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  49.61 
 
 
152 aa  121  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  43.53 
 
 
176 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  49.25 
 
 
161 aa  120  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  45.45 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  46.67 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  47.79 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  47.79 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  45.74 
 
 
152 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  42 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  46.09 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  45.19 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  50.38 
 
 
158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  47.86 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  46.27 
 
 
152 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  47.33 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  40.67 
 
 
164 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  47.15 
 
 
164 aa  111  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  43.51 
 
 
160 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  45.52 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  49.53 
 
 
186 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  45.8 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  44.7 
 
 
167 aa  99  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  44.35 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  39.44 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  45.45 
 
 
167 aa  85.1  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>