More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4240 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4344  8-amino-7-oxononanoate synthase  87.5 
 
 		 376 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.104104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4240  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 408 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.609227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2421  8-amino-7-oxononanoate synthase  80.05 
 
 		 378 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.961626  normal  0.0795977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  81.17 
 
 		 377 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3320  8-amino-7-oxononanoate synthase  73.94 
 
 		 376 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0718  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.37 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1473  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.93 
 
 		 379 aa  418  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.928571  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2777  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.4 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.773541  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2099  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.71 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.851935  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1254  8-amino-7-oxononanoate synthase  65.74 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2822  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.95 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2918  8-amino-7-oxononanoate synthase  63.04 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0491  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.19 
 
 		 378 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0429  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.19 
 
 		 378 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442423  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2917  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.07 
 
 		 371 aa  322  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177659  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.74 
 
 		 397 aa  239  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.91 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.75 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2978  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.94 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.748921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.29 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.33 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.45 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.53 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1911  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.99 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.28 
 
 		 399 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.99 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.55 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.43 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.77 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.4 
 
 		 389 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.38 
 
 		 398 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.92 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.08 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.02 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.13 
 
 		 385 aa  209  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2998  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.26 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.38 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.68 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.58 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.06 
 
 		 388 aa  206  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.83 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.47 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.82 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.74 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.29 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.89 
 
 		 407 aa  202  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.18 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5561  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.93 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.57 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  38 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.71 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.11 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.78 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.73 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0816  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.19 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.497874  normal  0.203864 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1561  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  33.05 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.158607  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1489  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.99 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16701  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.601431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.36 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.55 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2728  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.57 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.77 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.64 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0857  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.9 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0484111 
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.25 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0886  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.76 
 
 		 370 aa  196  9e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.88 
 
 		 396 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.45 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.99 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.88 
 
 		 394 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.75 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.32 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0613  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.07 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.46 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.32 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.02 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06645  probable 8-amino-7-oxononanoate synthase (Eurofung)  35.75 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.48 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.48 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.48 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.48 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0027  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.06 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.87483 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.02 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.75 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.48 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.48 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.28 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3628  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.03 
 
 		 380 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.62 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0002  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.53 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.2 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3094  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.81 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.607978  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.24 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2875  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.19 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  32.57 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.86 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6357  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.77 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0969  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.69 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211572  normal  0.251268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3077  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.81 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3137  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.81 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.820035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>