41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3775 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  327  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  83.33 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1689  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  68.52 
 
 		 162 aa  233  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  65.84 
 
 		 168 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1273  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40.67 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1412  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  43.24 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47097  predicted protein  37.89 
 
 		 287 aa  98.2  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40.91 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  33.12 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  32.41 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.93 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  33.33 
 
 		 500 aa  61.6  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.52 
 
 		 500 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.65 
 
 		 494 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  33.78 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.04 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.78 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  33.91 
 
 		 493 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.44 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.44 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  34.03 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.66 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.83 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  27.88 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.83 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  27.78 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  28.74 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.48 
 
 		 494 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.48 
 
 		 491 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.48 
 
 		 491 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  30.94 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.95 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  27.16 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.32 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  28.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.53 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17110  predicted protein  31.3 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0710818  normal  0.446796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.99 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_003296  RS05437  hypothetical protein  31.86 
 
 		 208 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>